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Im Jahr 2000 wollte eine Elterninitiative in Altenburg ein christliches Gymnasium eröffnen. Für das zukünftige Schulgebäude hatten sie sich die ehemalige Berufsschule ausgesucht. Nach einer Besichtigung des völlig desolaten Gebäudes mußte eine andere Gebäudeidee her. Man sprach von einer sanierten Regelschule im Bahnhofsbereich. Der Schulreferent machte der Initiative Mut, den Oberbürgermeister der Stadt Altenburg direkt daraufhin anzusprechen. Es klappte. Die Regelschule sollte keine Schüler mehr aufnehmen und das christliche Gymansium entsprechend in das Gebäude hineinwachsen. Das hat zwar nicht jedem gepasst, aber inzwischen gehört das Christliche Spalatin-Gymnasium zur Stadt Altenburg.
Am 06. Juni 2001 wurde dann der Schulverwaltungsausschuss gegründet. Kurz darauf, am 26. Juni 2001 fand schon der 1. Elternabend statt und am 12. August 2001 wurde das Christliche Gymnasium feierlich eröffnet.